全基因组范围代谢网络的构建和最小基因组研究

	全基因组范围代谢网络的构建和最小基因组研究
其他题名	Genome-scale metabolic network reconstruction and minimal genome research
	房柯池; 王晶
通讯作者邮箱	wangj@psych.ac.cn
心理所单位排序	1
摘要	全基因组范围代谢网络(genome-scale metabolic network,GSMN)的构建是合成生物学研究的一个重要研究手段。通过整合各种组学数据和借助计算机进行模拟分析,将基因型与表型的关系进行定量关联,从而为从全局的角度探索和揭示生物代谢机制,进而对生物进行合理的重新设计和工程改造提供了有效的框架。该方法在最小基因组研究中也有着突出的优势,通过计算机辅助的基因组最小化模拟与分析,能够系统鉴定微生物基因组基因的必需性。迄今为止,已有近百个基因组范围的代谢网络发表,覆盖的生物包括原核生物、真核生物和古生生物,并广泛应用于医药、能源、环境、工业和农业等多个领域,展现出了广阔的应用前景。将对全基因组范围代谢网络构建的方法、应用,特别是其在最小基因组研究中的应用作简要的综述。
其他摘要	Genome-scale metabolic network reconstruction has become indispensable framework for systematically exploring and understanding biological system by integrating various -omics data and taking advantages of computational simulation and analysis. The complex metabolic properties of living organisms can be accurately mimicked, predicted, controlled, and even re-designed by genome-scale metabolic network. This method has an outstanding merit in the minimal genome research, which is one of the major subjects of synthetic biology. So far, nearly 100 genome-scale metabolic networks have been published covering prokaryotes, archaea and eukaryotes. Genome-scale metabolic reconstruction has a broad spectrum of basic and practical applications, including biological discovery, metabolic engineering, phenotypic behavior, and bacteria evolution, and has been successfully applied in medicine, energy, environmental, industrial, agricultural, and other fields. In this paper, the methods of genome-scale metabolic network reconstruction, its application, as well as minimal genome research will be reviewed briefly.
关键词	全基因组范围代谢网络最小基因组合成生物学
学科领域	生理心理学/生物心理学
	2011
语种	中文
发表期刊	生命科学
ISSN	1004-0374
卷号	23 期号:9 页码:853-859
期刊论文类型	期刊论文
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收录类别	CSCD
CSCD记录号	CSCD:4343511
资助机构	基金项目：国家重点基础研究发展计划（“973”项目）（2011CBA00802）
引用统计
文献类型	期刊论文
条目标识符	http://ir.psych.ac.cn/handle/311026/14823
专题	中国科学院心理健康重点实验室
通讯作者	王晶
作者单位	中国科学院心理研究所心理健康院重点实验室
第一作者单位	中国科学院心理研究所
通讯作者单位	中国科学院心理研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	房柯池,王晶. 全基因组范围代谢网络的构建和最小基因组研究[J]. 生命科学,2011,23(9):853-859.
APA	房柯池,&王晶.(2011).全基因组范围代谢网络的构建和最小基因组研究.生命科学,23(9),853-859.
MLA	房柯池,et al."全基因组范围代谢网络的构建和最小基因组研究".生命科学 23.9(2011):853-859.

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全基因组范围代谢网络的构建和最小基因组研（848KB）	期刊论文	作者接受稿	限制开放	CC BY-NC-SA	请求全文